《摄大乘论释》（无性菩萨造）卷二亦言：
“最胜因者，所谓种子阿赖耶识。”
第八识既是有情生死轮回的因，亦是有情修行成阿罗汉、辟支佛、佛之因，故《大乘密严经》卷中载，金刚藏菩萨摩诃萨复告众言：
“诸仁者！阿赖耶识恒与一切染净之法而作所依，是诸圣人现法乐住三昧之境；人天等趣、诸佛国土悉以为因，常与诸乘而作种性；若能了悟即成佛道。”
因此，三界一切法，出三界的一切法，不论是染污的法，还是清净的法，都须以第八识为因才能出生、存在；复以此因极为殊胜，没有任何一法能超胜于祂，故又称之为善不善因、根本因、最胜因等。
诸法不能无因自生，对此龙树菩萨于《中论》卷一亦言：
“诸法不自生，亦不从他生；不共不无因，是故知无生。”
诸法在尚未出生前，则是“无”，“无”不能生有，所以诸法不能自己出生自己，否则就会造成“无中生有”的过失；又诸法若能自己出生自己，那能生就是所生，诸法自己同时也成为因与果，则世间因果不成。诸法也不是从自心藏识以外的“他法”所生，譬如一神教主张上帝创造万物，就是以为诸法从他法而生。诸法不是自法与他法共生出来的，也不是无因而生的，故知必定有一“无生无灭”、“原本自在”的——自心藏识能生一切法，必有一无生法之第八识的存在，才有万法的生灭变异。
对于因果、业报之实现，古印度的应成派“中观”误以为：因果业报可以离开自心藏识而自动实现。对此护法菩萨早有批判，如《成唯识论》卷三载，护法菩萨言：
“若无能持染净种识（第八识），一切因果皆不得成。有执大乘遣相空理为究竟者，依似比量拨无此识（第八识）及一切法，彼特违害前所引经，（其将）智断证修、染净因果皆执非实，（而）成大邪见……故应信有能持种心依之建立染净因果。彼心即是此第八识。”
故学人应信受佛语，融通经典，不可自以为是，执一非余。
三、轮回的过程及原理
无始劫以来，众生为了满足这一世虚妄之“我”的需要，不停地造业，所造的善恶业会转化为“种子”，保存在第八识阿赖耶识内；就像一部有声有色的电影能以无形的数据保存在电脑的硬盘中。众生死后，色身腐烂，识蕴的见闻觉知心也不存在了，但是末那识、阿赖耶识并没有坏灭。末那识因为我执的习气，舍不得让“自我”消失，于是藏识“接受”了末那识的“指令”，造出中阴身，经由中阴身再去“投胎”，于是又有了来世的“我”，这就是轮回的原理。
为了详细地说明轮回的原理，这里以六道中的人道轮回来举一个例子。比如这一世的“张三”，他活着的时候，作了一些善、恶业，这些善恶业，都会转化为“种子”，积存在他的藏识内。当“张三”濒临死亡，呼吸心跳将要止息之时（初死位），大脑（胜义根）中所保留的有关“张三”一生的“记忆”，会迅速移转至第八识阿赖耶识内，移转之过程如同放电影，自上而下一格一格地闪现，每一格所显现之善业、恶业，意识心都能清楚地了知。垂死之人一生的善恶业在瞬间全部“播放”完毕以后，便脉息俱无而进入正死位，生出中阴身。
善人之死，死时无诸苦患，亦无恶境现前，就像睡眠一样不知不觉，于中阴身现起觉知时，方知自己已死。造诸恶业者，死前及正死位有四大分离之种种痛苦，是其必须承受之果报。在正死位，藏识开始一分一分地舍身，渐渐地移转到中阴身内。藏识离开人体多少，中阴身就会形成多少。待藏识完全移转至中阴身，此时人体已无第八识持身，人才死尽（正死位结束），外在的表现就是体温完全消失，尸体与外界温度完全相等。
医学上的死亡是以呼吸、心跳停止或者脑死亡为标准的。佛教所说的死亡，是指藏识全部舍离身体。藏识完全舍身，快则八小时，慢的可能要一、两天。因此，医学上认定的死人，可能并没有完全死亡。故捐献遗体者要引起注意，手术前宜做必要的麻醉，以免发生意外。
当藏识全部移转至中阴身后，中阴身就完全形成了。中阴身是在众生死后，来世的生命形成以前这一特殊时间段里暂时存在的一种生命体，不属于六道中的一种。中阴身是死者的藏识执取其生前色身的四大种而成的，一般人看不见，有天眼通（或阴阳眼）的人能见。中阴身具足八识心王，其意识通生前这一世。然中阴身之大脑（胜义根）没有人类复杂，故其意识思维能力也较生前低劣。中阴身之第七识末那识仍然是死者生前的那一个，只不过是随第八识一起移转到中阴身中罢了，故末那识仍会依照生前的习气而运作。关于中阴身的状态，《瑜伽师地论》卷一，弥勒菩萨言：
“然（中阴身）于境界起戏论爱，随所当生，即彼形类中有而生（中阴身的模样和他将要往生那一道的众生是一样的，若来世要投生到畜生道中，那么他的中阴身就是畜生的样子）。又中有眼（中阴身的眼睛），犹如天眼，（视物）无有障碍，唯至生处（中阴身的天眼功能只能毫无障碍地看到他要投生的地方）。（中阴身）所趣无碍，如得神通，亦唯至生处（中阴身如有神足通，但也只能毫无障碍地行至他要投生的地方）。又（中阴身）由此（类似天眼之）眼，见己同类中有有情，及见自身当所生处（中阴身能看见同类的中阴身以及自己所要投生的地方）。”
故中阴身只有一点小神通，且是依业报而来，以便其能顺利地投生到下一世。又中阴身需以食物香气为食，若没有香气来长养，中阴身便会死亡。若中阴身是往生到人道者，七天一生死，最多经七次生死，四十九天内必定投生人间。
因此，在中阴身阶段，死者的家人可以做功德回向给死者，或请寺院的僧人超度，以便中阴身能投生到三善道里面去。众生死后，不必都要经过中阴身阶段，如往生到无色界、地狱，就无须经过中阴状态，人在这边死了，直接就出生到无色界或地狱里了。
中阴身的性质，在某些方面类似世人所说的“灵魂”。世人每以为：众生都有灵魂，灵魂永恒存在，是轮回的主体；有情死后灵魂再去投胎，就有了来世；在轮回的过程中，灵魂不断地更换躯壳，就像脱衣、穿衣一样。事实上，灵魂是不存在的，“灵魂”是一种自性见（常见）。
“张三”死后，在中阴身阶段，便又依业力不由自主地寻找来世的父母。“张三”的中阴身，能看见来世的父母行淫，等父母的精子和卵子结合时，“张三”的中阴身就会感受到寒风阴雨，随其福德，或看到家宅、楼阁，或看到草庵、丛林、窟穴等，便会不由自主地入住其中——中阴身由此进入受精卵后便告消失，中阴身所有的六识也跟着断灭了，仅剩末那识及藏识住于受精卵中，复由藏识执持此受精卵的发育生长。
不论是在受精卵阶段，还是成人阶段，受精卵、色身皆须阿赖耶识执持，才能维持正常的生理活动。“张三”的藏识住于胎中，借助母体提供的营养，制造来世的色身。因此，胎儿的身体并不是母亲制造的，而是执持胎儿色身的藏识制造的，母体不过是提供营养物质（四大种）供藏识用以制造胎儿色身的工具罢了。
由于早期的胎儿，其眼耳鼻舌及胜义根大脑等五根还没有发育完整，没有根尘相触，藏识便不会生出六识来了别，故早期的胎儿无见闻觉知。胎儿的成长过程，每七天有一个大的变化，《佛为难陀所说入胎经》《大宝积经》（卷五十六）等述之甚详，也为现代医学所验证，兹不赘述。
胎儿经十个月的成长，就会出胎。当“张三”的来世——胎儿生下来以后，假使父母给他取个名字叫“李四”，于是，“李四”又开始了他自己这一生的生命旅程。由于“李四”的意识心是依这一生的色身而有，是全新的，就无法记得上一生“张三”的事情（若有宿命通就能回忆前生之事）。这就是“张三”经过一次生死轮回以后，成为“李四”的过程。
这一世的“张三”所做的善恶业，是要由来世的“李四”受报，故五蕴并非有轮回，因此说因果报应非“自作自受”；由于末那识、阿赖耶识可以相续到来世——也即“张三”的末那识、阿赖耶识和“李四”的是相续的“同”一个，决定造业与受报的都是“同一个”末那识，所以又说因果报应亦非“异作异受”。这就是有关轮回的中道义。
当然，轮回不仅仅局限于人道，轮回往往是在六道里面进行的。众生来世要往生到六道中的某一道，与其心性、行为是相应的。譬如，心性残忍狠毒，无恶不作之人死时，他的藏识就会在“业”的作用下营造出和他心性相应的境界相——地狱，并为他造出地狱身，以便他来世在地狱中受报；如果是乐行十善业、乐修禅定，五欲又很淡薄的人死时，他的藏识便会营造出和他心性相应的境界相——天界，并为他造出天人身，以便他来世在天界中受报。
众生畏惧死亡的原因：一是恐惧自我的消失；二是生前造诸恶业，害怕遭到恶报；三是不明死亡的过程与原理，因不可知而生畏。若平生熏习佛法，积德行善，死亡只不过是一次净化与提升，何惧之有！
轮回是实现业报（果报）的一种方式，业报的实现还在不同众生个体之间进行。譬如上文所说之“张三”，若“张三”生前无恶不作，为了一己之利杀了“王五”，由此恶业，使得“张三”死后堕入地狱；等其地狱业受报完毕再生而为人，若遇着来世的“王五”，因缘会聚，就会出现某种机缘，导致“张三”死于来世的“王五”之手。所以，人类社会中不时会有人为了一些极小的争执而杀人，杀人之后，自己也不明白当时为何如此冲动而后悔不已，其实这就是业力的作用。
四、世间其他宗教对轮回的作用
人类的根本问题是：生从哪里来？死往何处去？生命存在的意义是什么？这三个问题导致了各种宗教的出现，如儒教、道教、一神教等。若以佛教的眼光来看，这些宗教都解决不了轮回问题，但是对有情的轮回可以起到一些积极的作用。
儒教是以孔子为先师，祖述尧舜，宪章文武，倡导王道德治、尊王攘夷和上下秩序的国家宗教（严格来说儒教是一种处世之学，并非宗教），若按儒家所说的“修身、齐家、治国、平天下”行事，死后多能再生于人间，于人道中轮回。
道教的雏形即春秋战国时期的道家学派。道家的代表人物是老子、庄子，世称老庄。老子的《道德经》所言多为欲界之事。老子谓“道生一，一生二，二生三，三生万物”，尚不明三界唯心之理。《庄子》之<大宗师>所言“颜回坐忘”，只是粗浅的未到地定境界，尚不及初禅。道家虽主张清静无为、物我两忘，然窥其境界，皆不离五蕴，尚在我见之中。后世道教的炼精化气、金丹、出阳神等，仍是三界有为法。道教的出阳神和佛教所说的法身、意生身都不同。法身本来而有，非因修得；意生身是佛菩萨以种智复藉三昧之力而成，并非修“精、气、神”所致。若按照道家道教所说而修，死后至多能往生到欲界天，而难到色界天。
一神教是外来之宗教，一神教因不明生命之实相，不明宇宙成住坏空之理，妄说世界及有情皆由造物主所创造，不承认有情皆有前世，皆有轮回。睽其经典所说，粗浅矛盾，修持境界至多在六欲天内，不及色界。
儒家、道教、一神教的信众，皆落于我见之中，无法了知佛教所说之我见以及断我见的内涵，何况是知诸阿罗汉、辟支佛、菩萨、佛之解脱境界。
世间更有一些邪教，邪教也有一套说辞，譬如法轮功表面上也讲“真善忍”，使人不知其邪而误入歧途。
信仰是指人们深信某种宗教、主义、某人、某神灵，或者某种物，并将其作为精神支柱。譬如拜金主义也是一种信仰，其以为金钱万能，可以解决所有的烦恼，所谓“有钱能使鬼推磨”。尽管世间人，乃至佛弟子也有一定的物质需求，但是并不会认为金钱是万能的。故信仰亦有正信和邪信之分。正信是对未知领域生起的胜解，正信能激发人们对崇高、神圣的欲求，有助于实现人生的价值，从而赋予短暂的一生以永恒的意义。邪信不一定就是邪恶，邪信多基于妄想，故特别强调盲从与迷信，只要求人们“信”而不必知道“为什么”。人类有三种需求，由低到高依次是：生理满足需求（如饮食、呼吸、睡眠、繁衍等需求）、精神愉悦需求（如文学、艺术、自我实现等需求）、心灵安宁需求（如信仰、宗教等需求）。邪信也能让人暂时获得一种不同于生理满足、精神愉悦的心理体验，故邪信者亦会呈现“法喜”充满的状态，尽管最终仍是水中捞月，空欢喜一场罢了。当然信仰何种宗教，要看各人的福德因缘，福德多者，能起正信，福德寡者，则起邪信；与哪一种宗教有缘，就会信仰哪一种宗教。
菩萨为度化众生，为破外道邪见，需要学习一些世间法的知识，了解一些外道法，但是，这是有前提的，《菩萨善戒经》（一卷本）言：
“若菩萨不读不诵如来正经，（却）读诵（佛教以外的世俗人所写的）世典、文颂、书疏者得罪。（阅读外道典籍而）不犯（菩萨戒）者，（有两种情况：一者，）若为论议，破于（外道）邪见（，此时可以阅读外道典籍）；（二者，）若二分（时间学习）佛经，一分（时间学习）外（道）书（籍，则不是犯戒）。何以故？为知外典是虚妄法，佛法真实故；为知世事故；不为世人所轻慢故。”
又如《菩萨戒本》载：
“若诸菩萨，安住菩萨净戒律仪。（如果菩萨违）越菩萨法，于异道论及诸外论研求善巧，深心宝玩，爱乐耽味，非如辛药而习近之，是名有犯有所违越（菩萨戒的行为），是染违犯。”
故如学人在没有打好佛法基础之前，便花大量的时间学习世俗的哲学、科学、书画、诗词艺术等外道法，成本末倒置，是有违菩萨戒的。
以上略说有情生死轮回的原理。生死可畏，学人欲解脱生死，当视自身根器，依照世尊开示的方法，实证三乘菩提之一种，成阿罗汉，或成辟支佛、佛，才能出离生死。世尊开示的修行方法，即是取证三乘菩提之行门，也即佛教的方法论，其中心内容，如《大乘本生心地观经》卷二，佛告五百长者所言：
“……诸化佛身，各各具足三十二相、八十种好，为诸资粮及四善根诸菩萨等二乘凡夫，随宜为说三乘妙法：为诸菩萨说应六波罗蜜（六度），令得阿耨多罗三藐三菩提究竟佛慧；为求辟支佛者，说应十二因缘法；为求声闻者，说应四谛法（四圣谛），度生老病死究竟涅槃。”
佛子学佛，即是按照世尊所说的方法去修证——声闻乘人实修四圣谛而证声闻菩提，缘觉乘人实修十二因缘法而证缘觉菩提，大乘菩萨实修六度而证佛菩提的过程。三乘学人所修三乘菩提之内涵及其道次第略说如下。
